Protein–RNA interactions for Protein: B9EKK6

Nxpe3, Family with sequence similarity 55, member C, mousemouse

Predictions only

Length 559 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxpe3B9EKK6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Nxpe3B9EKK6 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Nxpe3B9EKK6 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.9 ms