Protein–RNA interactions for Protein: B9EJA2

Cttnbp2, Cortactin-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,648 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cttnbp2B9EJA2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 1300002E11Rik-207ENSMUST00000211443 767 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Cttnbp2B9EJA2 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Nt5c-202ENSMUST00000106530 836 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Cttnbp2B9EJA2 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms