Protein–RNA interactions for Protein: B8JJN0

Gm20547, Predicted gene 20547, mousemouse

Predictions only

Length 1,276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20547B8JJN0 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Gm20547B8JJN0 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Gm20547B8JJN0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms