Protein–RNA interactions for Protein: B7ZC55

Apol6, Apolipoprotein L 6, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol6B7ZC55 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Apol6B7ZC55 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms