Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Gm6133B2RY53 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Gm6133B2RY53 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms