Protein–RNA interactions for Protein: B2RXQ2

Ppfia1, Ppfia1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia1B2RXQ2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Ppfia1B2RXQ2 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ppfia1B2RXQ2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms