Protein–RNA interactions for Protein: B2RUS7

Abcc8, ATP-binding cassette, sub-family C (CFTR/MRP), member 8, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcc8B2RUS7 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm14221-202ENSMUST00000209603 1437 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Sumo3-204ENSMUST00000129492 487 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm13849-201ENSMUST00000153328 835 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Abcc8B2RUS7 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Triqk-201ENSMUST00000143186 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Gssos1-201ENSMUST00000142509 716 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 1500011B03Rik-202ENSMUST00000112160 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Thap7-201ENSMUST00000100125 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 AC151286.1-201ENSMUST00000198489 145 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
Abcc8B2RUS7 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.1 ms