Protein–RNA interactions for Protein: B2RQG2

Phf3, PHD finger protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,025 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf3B2RQG2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Phf3B2RQG2 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms