Protein–RNA interactions for Protein: B1B0R1

Gm2012, Predicted gene 2012, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2012B1B0R1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Gm2012B1B0R1 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Gm2012B1B0R1 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms