Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
CK137956B1AYM9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CK137956B1AYM9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15 ms