Protein–RNA interactions for Protein: B1AVU6

Gm436, Predicted gene 436, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm436B1AVU6 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Lgr6-202ENSMUST00000137968 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Gm436B1AVU6 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Gm436B1AVU6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms