Protein–RNA interactions for Protein: B1AVB3

Scml2, Scm polycomb group protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 969 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scml2B1AVB3 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Scml2B1AVB3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Gm21863-201ENSMUST00000179133 336 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Scml2B1AVB3 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Scml2B1AVB3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms