Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

Predictions only

Length 517 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Trabd2bB1ATG9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Trabd2bB1ATG9 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms