Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Spocd1B1ASB6 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Spocd1B1ASB6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms