Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Grik3B1AS29 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms