Protein–RNA interactions for Protein: B1AQL3

Tmem235, Transmembrane protein 235, mousemouse

Predictions only

Length 211 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem235B1AQL3 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Tmem235B1AQL3 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Tmem235B1AQL3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms