Protein–RNA interactions for Protein: A9JSM3

Tmem238, Transmembrane protein 238, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem238A9JSM3 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 P4ha1-202ENSMUST00000092512 2387 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Vax2os-202ENSMUST00000150233 595 ntTSL 3 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.42
Tmem238A9JSM3 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Igdcc4-202ENSMUST00000077696 6361 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cdk18-201ENSMUST00000027697 4355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Daxx-201ENSMUST00000079421 2580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Hnf1b-201ENSMUST00000021016 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Coil-202ENSMUST00000107898 3120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tsks-202ENSMUST00000120929 1843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Anapc16-204ENSMUST00000182898 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ddhd1-203ENSMUST00000111828 9802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Zcchc13-201ENSMUST00000033692 1085 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Tmem238A9JSM3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms