Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Gm3173A6NAS3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Gm3173A6NAS3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms