Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Ccdc9bA3KGF9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Ccdc9bA3KGF9 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms