Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
Atp8b5A3FIN4 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Atp8b5A3FIN4 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms