Protein–RNA interactions for Protein: A2BFR3

H2al1j, Histone H2A, mousemouse

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Length 109 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al1jA2BFR3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.21□□□□□ -0.29
H2al1jA2BFR3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.21□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.2□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mapk8ip1-202ENSMUST00000111279 3274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.19□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
H2al1jA2BFR3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
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