Protein–RNA interactions for Protein: A2AVZ9

Slc43a3, Solute carrier family 43 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 502 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc43a3A2AVZ9 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slc43a3A2AVZ9 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Slc43a3A2AVZ9 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.3 ms