Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Itga8A2ARA8 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Itga8A2ARA8 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms