Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Rtf1A2AQ19 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rtf1A2AQ19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
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Rtf1A2AQ19 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rtf1A2AQ19 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
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