Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ07

Tubb1, Tubulin beta-1 chain, mousemouse

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb1A2AQ07 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tubb1A2AQ07 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms