Protein–RNA interactions for Protein: A2ANU3

Syndig1, Synapse differentiation-inducing gene protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syndig1A2ANU3 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syndig1A2ANU3 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Syndig1A2ANU3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.1 ms