Protein–RNA interactions for Protein: A2AKB4

Frmpd1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd1A2AKB4 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 1810008I18Rik-202ENSMUST00000187848 819 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 AC124549.3-201ENSMUST00000225541 367 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 1810062O18Rik-203ENSMUST00000129237 647 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Frmpd1A2AKB4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Wdyhv1-206ENSMUST00000227142 786 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Meaf6-201ENSMUST00000055213 872 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Aga-201ENSMUST00000033920 1181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Pcp2-204ENSMUST00000136105 504 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Frmpd1A2AKB4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.2 ms