Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Mcm9-201ENSMUST00000075540 4882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.06□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.05□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.04□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.03□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.16
Cldn34dA2AGU5 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Cldn34dA2AGU5 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.02□□□□□ -0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms