Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Kcnt1-213ENSMUST00000198204 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Axin1-201ENSMUST00000074370 3777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Mapk8ip3-203ENSMUST00000115229 5603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ubash3b-201ENSMUST00000044155 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Rhbdl2A2AGA4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Adcy1-201ENSMUST00000020706 12259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ube2d3-212ENSMUST00000197859 3833 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Rhbdl2A2AGA4 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms