Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR3

Frmpd4, FERM and PDZ domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Frmpd4A2AFR3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Frmpd4A2AFR3 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Frmpd4A2AFR3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms