Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rbbp8nlA2ABX0 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rbbp8nlA2ABX0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms