Protein–RNA interactions for Protein: A1Z198

Nlrp1b, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1b allele 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,177 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1bA1Z198 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ssc4d-204ENSMUST00000111153 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Nlrp1bA1Z198 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms