Protein–RNA interactions for Protein: A0A1B0GSI2

1700018G05Rik, RIKEN cDNA 1700018G05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 66 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018G05RikA0A1B0GSI2 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.44□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tle3-218ENSMUST00000178113 5205 ntTSL 5 BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.43□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.42□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Pcsk5-201ENSMUST00000025618 6675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.74
1700018G05RikA0A1B0GSI2 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC10.4□□□□□ -0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms