Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms