Protein–RNA interactions for Protein: A0A0R4J054

4921501E09Rik, RIKEN cDNA 4921501E09, mousemouse

Predictions only

Length 908 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
4921501E09RikA0A0R4J054 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
4921501E09RikA0A0R4J054 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms