Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YTW6

Scn2a, Sodium channel protein, mousemouse

Predictions only

Length 2,006 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scn2aA0A0J9YTW6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Scn2aA0A0J9YTW6 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Scn2aA0A0J9YTW6 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms