Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P1

Trbv30, T cell receptor beta, variable 30 (Fragment), mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv30A0A0B4J1P1 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC12.77□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.76□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.75□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.74□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
Trbv30A0A0B4J1P1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC12.73□□□□□ -0.37
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