Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H4

Trbv19, T cell receptor beta, variable 19 (Fragment), mousemouse

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Length 117 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Trbv19A0A0B4J1H4 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Trbv19A0A0B4J1H4 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
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