Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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