Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1G8

Trbv2, T cell receptor beta, variable 2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv2A0A0B4J1G8 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv2A0A0B4J1G8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Trbv2A0A0B4J1G8 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Trbv2A0A0B4J1G8 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
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Trbv2A0A0B4J1G8 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Trbv2A0A0B4J1G8 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
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