Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YYE2

Trbv3, T cell receptor beta, variable 3 (Fragment), mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv3A0A0A6YYE2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Trbv3A0A0A6YYE2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv3A0A0A6YYE2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Trbv3A0A0A6YYE2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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