Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Larp1bA0A0A6YXJ7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms