Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YX06

Trbv21, T cell receptor beta, variable 21 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv21A0A0A6YX06 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Gm37592-201ENSMUST00000192741 373 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trbv21A0A0A6YX06 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 4930412F09Rik-201ENSMUST00000139006 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trbv21A0A0A6YX06 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms