Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B638

Trav4-2, T cell receptor alpha variable 4-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 110 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav4-2A0A075B638 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Trav4-2A0A075B638 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Trav4-2A0A075B638 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms