Protein–RNA interactions for Protein: A0A075B5J5

Trbv31, T cell receptor beta, variable 31, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv31A0A075B5J5 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Trbv31A0A075B5J5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Trbv31A0A075B5J5 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
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Trbv31A0A075B5J5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv31A0A075B5J5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
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Trbv31A0A075B5J5 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.32□□□□□ -0.28
Trbv31A0A075B5J5 Gm715-201ENSMUST00000117865 831 ntBASIC13.32□□□□□ -0.28
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