Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLI2

Col5a3, Collagen type V alpha 3 chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,739 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a3Q9JLI2 Gm43749-201ENSMUST00000199345 352 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm44353-201ENSMUST00000200618 138 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-0.24□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Snord67-201ENSMUST00000104033 111 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm8034-201ENSMUST00000178853 132 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 7330423F06Rik-201ENSMUST00000197499 301 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 AC126939.1-201ENSMUST00000224943 226 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Mir183-201ENSMUST00000083685 70 ntBASIC-0.25□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Mir669h-201ENSMUST00000116944 125 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23715-201ENSMUST00000157354 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22212-201ENSMUST00000158096 106 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23384-201ENSMUST00000158593 103 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0.26□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm24263-201ENSMUST00000104059 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23065-201ENSMUST00000158236 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm24842-201ENSMUST00000158681 54 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 mt-Tw-201ENSMUST00000082397 67 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Mir669m-1-201ENSMUST00000158945 98 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-0.27□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm22195-201ENSMUST00000116861 108 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25993-201ENSMUST00000175391 80 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm23239-201ENSMUST00000083006 181 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm25337-201ENSMUST00000083723 104 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Snord80-201ENSMUST00000083801 81 ntBASIC-0.28□□□□□ -2.45
Col5a3Q9JLI2 Gm14533-201ENSMUST00000117088 93 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25656-201ENSMUST00000158466 66 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-0.29□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26018-201ENSMUST00000104406 128 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26225-201ENSMUST00000082508 135 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir103-1-201ENSMUST00000083619 86 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26395-201ENSMUST00000104094 132 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24590-201ENSMUST00000116699 119 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22016-201ENSMUST00000158793 114 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25296-201ENSMUST00000082566 67 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-0.3□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-0.31□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25943-201ENSMUST00000103791 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-4-201ENSMUST00000178801 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25285-201ENSMUST00000178951 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-6-201ENSMUST00000180061 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Mir466c-2-201ENSMUST00000180211 90 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-0.32□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Snord70-201ENSMUST00000104157 87 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Snord72-201ENSMUST00000104549 81 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25623-201ENSMUST00000157216 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22503-201ENSMUST00000158983 115 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm26054-201ENSMUST00000083037 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm24593-201ENSMUST00000122507 106 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22349-201ENSMUST00000157864 107 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0.33□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm22455-201ENSMUST00000082580 71 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-0.34□□□□□ -2.46
Col5a3Q9JLI2 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm26478-201ENSMUST00000122611 133 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm22720-201ENSMUST00000122710 87 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Snora62-201ENSMUST00000082991 149 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm22681-201ENSMUST00000083853 106 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Mir466b-3-201ENSMUST00000103806 81 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23197-201ENSMUST00000158809 112 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm17364-201ENSMUST00000163881 72 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm22775-201ENSMUST00000177630 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23569-201ENSMUST00000180120 120 ntBASIC-0.35□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25316-201ENSMUST00000116826 118 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25071-201ENSMUST00000175232 70 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0.36□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
Col5a3Q9JLI2 Mir344h-1-201ENSMUST00000174922 60 ntBASIC-0.37□□□□□ -2.47
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