Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWY9

Rpain, RPA-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpainQ9CWY9 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RpainQ9CWY9 Gm43944-201ENSMUST00000205220 120 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RpainQ9CWY9 AC116319.1-201ENSMUST00000227765 222 ntBASIC1.34□□□□□ -2.19
RpainQ9CWY9 Gm22203-201ENSMUST00000158605 58 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Snord96a-201ENSMUST00000082791 81 ntBASIC1.33□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Olfr1100-202ENSMUST00000117211 2937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23991-201ENSMUST00000117033 93 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC1.32□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Olfr832-202ENSMUST00000218385 4435 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.32□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm24073-201ENSMUST00000158177 106 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22406-201ENSMUST00000174923 93 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23410-201ENSMUST00000179967 107 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 AC160550.1-201ENSMUST00000228659 181 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23301-201ENSMUST00000082713 65 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22505-201ENSMUST00000082956 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22363-201ENSMUST00000083100 108 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23814-201ENSMUST00000083230 102 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Olfr805-203ENSMUST00000216794 3199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.31□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Mir343-201ENSMUST00000102360 75 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Snord69-201ENSMUST00000104024 80 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22541-201ENSMUST00000158165 127 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm13723-201ENSMUST00000130722 5036 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC1.3□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm25968-201ENSMUST00000157167 100 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm22466-201ENSMUST00000175278 69 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm27420-201ENSMUST00000183823 79 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm26224-201ENSMUST00000082506 80 ntBASIC1.29□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm25274-201ENSMUST00000104296 135 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm26274-201ENSMUST00000157103 321 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC1.28□□□□□ -2.2
RpainQ9CWY9 Gm25416-201ENSMUST00000104221 107 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Snord2-201ENSMUST00000157899 69 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm22100-201ENSMUST00000157926 63 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24549-201ENSMUST00000158647 139 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Traj60-201ENSMUST00000167781 54 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir7091-201ENSMUST00000184075 79 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 AC211878.4-201ENSMUST00000220970 262 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir377-201ENSMUST00000083504 68 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir500-201ENSMUST00000093600 92 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.27□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm25170-201ENSMUST00000104191 129 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir6342-201ENSMUST00000183870 125 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24311-201ENSMUST00000082570 104 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir448-201ENSMUST00000083516 112 ntBASIC1.26□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24331-201ENSMUST00000175099 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir100-201ENSMUST00000175270 80 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm23801-201ENSMUST00000175561 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24485-201ENSMUST00000178283 67 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir30a-201ENSMUST00000083471 71 ntBASIC1.25□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm25040-201ENSMUST00000103877 66 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm26301-201ENSMUST00000104813 95 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm10945-201ENSMUST00000105596 60 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24777-201ENSMUST00000157644 107 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm38074-201ENSMUST00000193467 145 ntTSL 5 BASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.24□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm25552-201ENSMUST00000158081 91 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm23856-201ENSMUST00000158380 99 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm38323-201ENSMUST00000192450 210 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm44490-201ENSMUST00000198566 127 ntBASIC1.23□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Mir376b-201ENSMUST00000195930 82 ntBASIC1.22□□□□□ -2.21
RpainQ9CWY9 Arhgap5-204ENSMUST00000219443 9323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm6272-201ENSMUST00000121256 171 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24808-201ENSMUST00000157993 118 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24500-201ENSMUST00000158447 124 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir1954-201ENSMUST00000175595 86 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm16399-201ENSMUST00000181423 219 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Trgj1-201ENSMUST00000200495 60 ntAPPRIS P1 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Svbp-204ENSMUST00000210595 150 ntTSL 5 BASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir200b-201ENSMUST00000083615 70 ntBASIC1.21□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Traj45-201ENSMUST00000103697 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24396-201ENSMUST00000116905 93 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm27656-201ENSMUST00000185055 80 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Snhg14-211ENSMUST00000189581 6861 ntTSL 1 (best) BASIC1.2□□□□□ -2.22
RpainQ9CWY9 Snord71-201ENSMUST00000104361 85 ntBASIC1.19□□□□□ -2.22
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