Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Gm11857-201ENSMUST00000119817 324 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Mir6905-201ENSMUST00000184228 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Mir1949-202ENSMUST00000199259 70 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm43911-201ENSMUST00000203097 76 ntBASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Vmn1r75-204ENSMUST00000227611 4336 ntAPPRIS ALT2 BASIC1.58□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Snord13-201ENSMUST00000157627 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23761-201ENSMUST00000158347 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23853-201ENSMUST00000158375 104 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm43960-201ENSMUST00000204249 5020 ntBASIC1.57□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25756-201ENSMUST00000103990 136 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23203-201ENSMUST00000104374 107 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23989-201ENSMUST00000117030 66 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm6293-201ENSMUST00000050339 195 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25128-201ENSMUST00000083339 76 ntBASIC1.56□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm25609-201ENSMUST00000104019 104 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm24221-201ENSMUST00000158833 313 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Mir7063-201ENSMUST00000184158 91 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm42533-201ENSMUST00000196247 157 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 mt-Tl2-201ENSMUST00000082417 71 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Mir211-201ENSMUST00000083651 106 ntBASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr307-203ENSMUST00000217494 4515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.55□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm22780-201ENSMUST00000104084 132 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13065-201ENSMUST00000119178 141 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm22413-201ENSMUST00000175465 85 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm23416-201ENSMUST00000175520 95 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm44211-201ENSMUST00000204867 145 ntBASIC1.54□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm27974-201ENSMUST00000183415 105 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm20305-201ENSMUST00000193226 177 ntBASIC1.53□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Olfr820-202ENSMUST00000214917 4701 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.53□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Zfp654-201ENSMUST00000052588 4741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC1.53□□□□□ -2.16
Chmp3Q9CQ10 Gm13231-201ENSMUST00000119218 2850 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm26082-201ENSMUST00000104070 127 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Mir1197-201ENSMUST00000117037 120 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22520-201ENSMUST00000158269 129 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22074-201ENSMUST00000158595 113 ntBASIC1.52□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22095-201ENSMUST00000158984 150 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm25328-201ENSMUST00000175013 107 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm23636-201ENSMUST00000175070 95 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm25138-201ENSMUST00000083248 136 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Mir126a-201ENSMUST00000083606 73 ntBASIC1.51□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm24154-201ENSMUST00000175261 130 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm25300-201ENSMUST00000175284 84 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm27717-201ENSMUST00000183933 151 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22652-201ENSMUST00000083207 131 ntBASIC1.5□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Mir15a-201ENSMUST00000175266 84 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Mir7059-201ENSMUST00000184825 59 ntBASIC1.49□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm23012-201ENSMUST00000104149 83 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm24233-201ENSMUST00000104317 122 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm23708-201ENSMUST00000104367 123 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm24134-201ENSMUST00000083361 71 ntBASIC1.48□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm382-201ENSMUST00000096332 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm22663-201ENSMUST00000158721 102 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Mir3968-201ENSMUST00000175355 100 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm27711-201ENSMUST00000183802 118 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Gm27894-201ENSMUST00000184177 92 ntBASIC1.47□□□□□ -2.17
Chmp3Q9CQ10 Tex15-201ENSMUST00000009772 8405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.47□□□□□ -2.17
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Chmp3Q9CQ10 Gm27549-201ENSMUST00000183508 62 ntBASIC1.46□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir741-201ENSMUST00000103931 71 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm23329-201ENSMUST00000157415 108 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir3070a-201ENSMUST00000175468 89 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm23726-201ENSMUST00000178937 67 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm44483-201ENSMUST00000197203 97 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm24624-201ENSMUST00000082617 164 ntBASIC1.45□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Rab11fip4os2-202ENSMUST00000132921 355 ntTSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir7052-201ENSMUST00000184821 65 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Ighv1-23-201ENSMUST00000194625 351 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 AC156794.1-201ENSMUST00000214415 214 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm23785-201ENSMUST00000116741 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm25847-201ENSMUST00000116793 96 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir3108-201ENSMUST00000175500 79 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir6240-201ENSMUST00000184281 117 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm24918-201ENSMUST00000083022 130 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm24252-201ENSMUST00000083700 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm25768-201ENSMUST00000158570 98 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm23245-201ENSMUST00000083370 135 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm11111-201ENSMUST00000112956 99 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Gm23328-201ENSMUST00000157418 132 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir3064-201ENSMUST00000175532 67 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir7010-201ENSMUST00000183464 63 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Snord95-201ENSMUST00000082846 68 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Mir219a-2-201ENSMUST00000083551 97 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
Chmp3Q9CQ10 Traj34-201ENSMUST00000103707 58 ntAPPRIS P1 BASIC1.4□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 n-R5s6-201ENSMUST00000122663 88 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm26485-201ENSMUST00000158019 64 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm29432-201ENSMUST00000185397 139 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm12432-201ENSMUST00000119540 186 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm22485-201ENSMUST00000157990 109 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm22980-201ENSMUST00000082608 70 ntBASIC1.39□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm26438-201ENSMUST00000082593 107 ntBASIC1.38□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm23826-201ENSMUST00000157394 119 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm25894-201ENSMUST00000083458 75 ntBASIC1.37□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC1.36□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm11966-201ENSMUST00000119907 87 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm24378-201ENSMUST00000122699 106 ntBASIC1.36□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm21836-201ENSMUST00000178787 63 ntAPPRIS P1 BASIC1.35□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Gm25354-201ENSMUST00000179110 105 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
Chmp3Q9CQ10 Mir196b-201ENSMUST00000083509 85 ntBASIC1.35□□□□□ -2.19
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