Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1
Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mouse
Protein |
RNA |
Prediction (catRAPID) |
Interaction (Experimental data) |
Gene |
UniProt Accession |
Transcript Symbol |
Ensembl Transcript ID |
Length |
Transcript Status |
Prediction Score |
Prediction z-Score |
p-Value |
Fold Change |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23679-201 | ENSMUST00000083161 | 119 nt | BASIC | -1,73 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir802-201 | ENSMUST00000103258 | 97 nt | BASIC | -1,74 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24132-201 | ENSMUST00000104745 | 91 nt | BASIC | -1,74 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm11644-201 | ENSMUST00000119735 | 150 nt | BASIC | -1,74 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26124-201 | ENSMUST00000083359 | 108 nt | BASIC | -1,74 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25985-201 | ENSMUST00000122677 | 107 nt | BASIC | -1,75 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24202-201 | ENSMUST00000082948 | 103 nt | BASIC | -1,75 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AL603630.1-201 | ENSMUST00000214781 | 147 nt | BASIC | -1,76 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25635-201 | ENSMUST00000082675 | 131 nt | BASIC | -1,76 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24717-201 | ENSMUST00000157522 | 124 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23141-201 | ENSMUST00000178682 | 94 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27699-201 | ENSMUST00000183553 | 180 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir509-201 | ENSMUST00000196089 | 75 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26125-201 | ENSMUST00000083357 | 107 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25684-201 | ENSMUST00000083941 | 107 nt | BASIC | -1,77 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25680-201 | ENSMUST00000116917 | 126 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22635-201 | ENSMUST00000116962 | 126 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26369-201 | ENSMUST00000157825 | 100 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23260-201 | ENSMUST00000158317 | 172 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25653-201 | ENSMUST00000158473 | 138 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26454-201 | ENSMUST00000082682 | 107 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24612-201 | ENSMUST00000083267 | 107 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir3071-201 | ENSMUST00000093621 | 80 nt | BASIC | -1,78 | □□□□□ -2,69 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23607-201 | ENSMUST00000104550 | 126 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23261-201 | ENSMUST00000158316 | 136 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24003-201 | ENSMUST00000158455 | 100 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25618-201 | ENSMUST00000179484 | 107 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27935-201 | ENSMUST00000183894 | 79 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm17522-202 | ENSMUST00000186631 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm17412-202 | ENSMUST00000189566 | 174 nt | TSL 1 (best) BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir29b-1-201 | ENSMUST00000083670 | 71 nt | BASIC | -1,79 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25417-201 | ENSMUST00000104212 | 131 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | 4921527H02Rik-201 | ENSMUST00000196028 | 246 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm18502-201 | ENSMUST00000218679 | 199 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC154245.1-201 | ENSMUST00000224615 | 601 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC132833.2-201 | ENSMUST00000228699 | 157 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22298-201 | ENSMUST00000082662 | 133 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Zfp813-ps-201 | ENSMUST00000186652 | 2506 nt | BASIC | -1,8 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22336-201 | ENSMUST00000157719 | 107 nt | BASIC | -1,81 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22089-201 | ENSMUST00000158336 | 102 nt | BASIC | -1,81 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm26403-201 | ENSMUST00000158500 | 105 nt | BASIC | -1,82 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27285-201 | ENSMUST00000183875 | 127 nt | BASIC | -1,82 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir6951-201 | ENSMUST00000183910 | 75 nt | BASIC | -1,82 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22805-201 | ENSMUST00000082739 | 107 nt | BASIC | -1,82 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir29a-201 | ENSMUST00000083676 | 88 nt | BASIC | -1,82 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25390-201 | ENSMUST00000157341 | 103 nt | BASIC | -1,83 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24047-201 | ENSMUST00000102405 | 104 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23528-201 | ENSMUST00000104571 | 132 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22539-201 | ENSMUST00000158167 | 117 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22429-201 | ENSMUST00000158553 | 130 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25834-201 | ENSMUST00000158916 | 101 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22454-201 | ENSMUST00000082583 | 107 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23445-201 | ENSMUST00000082800 | 107 nt | BASIC | -1,84 | □□□□□ -2,7 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir702-201 | ENSMUST00000102285 | 109 nt | BASIC | -1,85 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Snora15-201 | ENSMUST00000177461 | 131 nt | BASIC | -1,85 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27263-201 | ENSMUST00000184760 | 76 nt | BASIC | -1,86 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22451-201 | ENSMUST00000122803 | 151 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24246-201 | ENSMUST00000157315 | 132 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22165-201 | ENSMUST00000158414 | 103 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23477-201 | ENSMUST00000158882 | 128 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Vmn2r-ps116-201 | ENSMUST00000175997 | 126 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23017-201 | ENSMUST00000177583 | 72 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22348-201 | ENSMUST00000178674 | 79 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23722-201 | ENSMUST00000083002 | 130 nt | BASIC | -1,87 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Traj53-201 | ENSMUST00000103690 | 66 nt | APPRIS P1 BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Traj33-201 | ENSMUST00000103708 | 57 nt | APPRIS P1 BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm27579-201 | ENSMUST00000158113 | 63 nt | BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm43324-201 | ENSMUST00000197482 | 289 nt | BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Olfr1041-ps1-201 | ENSMUST00000215884 | 271 nt | BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | mt-Tr-201 | ENSMUST00000082412 | 68 nt | BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23344-201 | ENSMUST00000083818 | 68 nt | BASIC | -1,88 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm17020-201 | ENSMUST00000172274 | 274 nt | BASIC | -1,89 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir7673-201 | ENSMUST00000184567 | 64 nt | BASIC | -1,89 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22708-201 | ENSMUST00000158987 | 103 nt | BASIC | -1,9 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC157602.1-201 | ENSMUST00000197446 | 105 nt | BASIC | -1,9 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm44922-201 | ENSMUST00000206690 | 90 nt | BASIC | -1,9 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | AC122327.1-201 | ENSMUST00000220778 | 108 nt | BASIC | -1,9 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22709-201 | ENSMUST00000116893 | 111 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir122-201 | ENSMUST00000083468 | 66 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mirlet7a-1-201 | ENSMUST00000083487 | 94 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,71 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23986-201 | ENSMUST00000157144 | 63 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23500-201 | ENSMUST00000157735 | 98 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23351-201 | ENSMUST00000158427 | 125 nt | BASIC | -1,91 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm45125-201 | ENSMUST00000206908 | 151 nt | BASIC | -1,92 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24718-201 | ENSMUST00000157521 | 136 nt | BASIC | -1,93 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Snord80-202 | ENSMUST00000199023 | 77 nt | BASIC | -1,93 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Olfr880-ps1-201 | ENSMUST00000212344 | 229 nt | BASIC | -1,93 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | mt-Ts2-201 | ENSMUST00000082416 | 59 nt | BASIC | -1,93 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir466b-7-201 | ENSMUST00000103804 | 88 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir466b-5-201 | ENSMUST00000103900 | 88 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm14838-201 | ENSMUST00000118913 | 248 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23955-201 | ENSMUST00000157214 | 100 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25493-201 | ENSMUST00000157375 | 103 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm22446-201 | ENSMUST00000180108 | 104 nt | BASIC | -1,94 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir21b-201 | ENSMUST00000184317 | 108 nt | BASIC | -1,95 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Mir494-201 | ENSMUST00000093632 | 85 nt | BASIC | -1,95 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm37545-201 | ENSMUST00000186512 | 148 nt | BASIC | -1,96 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm24697-201 | ENSMUST00000083881 | 107 nt | BASIC | -1,96 | □□□□□ -2,72 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm25915-201 | ENSMUST00000104265 | 126 nt | BASIC | -1,97 | □□□□□ -2,73 | | |
Ccdc171 | E9Q1U1 | Gm23909-201 | ENSMUST00000104598 | 131 nt | BASIC | -1,97 | □□□□□ -2,73 | | |
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