Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1U1

Ccdc171, Coiled-coil domain-containing protein 171, mousemouse

Predictions only

Length 1,324 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc171E9Q1U1 Gm23679-201ENSMUST00000083161 119 ntBASIC-1.73□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Mir802-201ENSMUST00000103258 97 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm24132-201ENSMUST00000104745 91 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm11644-201ENSMUST00000119735 150 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm26124-201ENSMUST00000083359 108 ntBASIC-1.74□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm25985-201ENSMUST00000122677 107 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm24202-201ENSMUST00000082948 103 ntBASIC-1.75□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 AL603630.1-201ENSMUST00000214781 147 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm25635-201ENSMUST00000082675 131 ntBASIC-1.76□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm24717-201ENSMUST00000157522 124 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm23141-201ENSMUST00000178682 94 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm27699-201ENSMUST00000183553 180 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Mir509-201ENSMUST00000196089 75 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm26125-201ENSMUST00000083357 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm25684-201ENSMUST00000083941 107 ntBASIC-1.77□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm25680-201ENSMUST00000116917 126 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm22635-201ENSMUST00000116962 126 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm26369-201ENSMUST00000157825 100 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm23260-201ENSMUST00000158317 172 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm25653-201ENSMUST00000158473 138 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm26454-201ENSMUST00000082682 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm24612-201ENSMUST00000083267 107 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Mir3071-201ENSMUST00000093621 80 ntBASIC-1.78□□□□□ -2.69
Ccdc171E9Q1U1 Gm23607-201ENSMUST00000104550 126 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm23261-201ENSMUST00000158316 136 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm24003-201ENSMUST00000158455 100 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm25618-201ENSMUST00000179484 107 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm27935-201ENSMUST00000183894 79 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm17522-202ENSMUST00000186631 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm17412-202ENSMUST00000189566 174 ntTSL 1 (best) BASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Mir29b-1-201ENSMUST00000083670 71 ntBASIC-1.79□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm25417-201ENSMUST00000104212 131 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 4921527H02Rik-201ENSMUST00000196028 246 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm18502-201ENSMUST00000218679 199 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 AC154245.1-201ENSMUST00000224615 601 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 AC132833.2-201ENSMUST00000228699 157 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22298-201ENSMUST00000082662 133 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Zfp813-ps-201ENSMUST00000186652 2506 ntBASIC-1.8□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22336-201ENSMUST00000157719 107 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22089-201ENSMUST00000158336 102 ntBASIC-1.81□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm26403-201ENSMUST00000158500 105 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm27285-201ENSMUST00000183875 127 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Mir6951-201ENSMUST00000183910 75 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22805-201ENSMUST00000082739 107 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Mir29a-201ENSMUST00000083676 88 ntBASIC-1.82□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm25390-201ENSMUST00000157341 103 ntBASIC-1.83□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm24047-201ENSMUST00000102405 104 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22539-201ENSMUST00000158167 117 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22429-201ENSMUST00000158553 130 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm25834-201ENSMUST00000158916 101 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm22454-201ENSMUST00000082583 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Gm23445-201ENSMUST00000082800 107 ntBASIC-1.84□□□□□ -2.7
Ccdc171E9Q1U1 Mir702-201ENSMUST00000102285 109 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Snora15-201ENSMUST00000177461 131 ntBASIC-1.85□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm27263-201ENSMUST00000184760 76 ntBASIC-1.86□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm22451-201ENSMUST00000122803 151 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm24246-201ENSMUST00000157315 132 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm22165-201ENSMUST00000158414 103 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm23477-201ENSMUST00000158882 128 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Vmn2r-ps116-201ENSMUST00000175997 126 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm23017-201ENSMUST00000177583 72 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm22348-201ENSMUST00000178674 79 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm23722-201ENSMUST00000083002 130 ntBASIC-1.87□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Traj53-201ENSMUST00000103690 66 ntAPPRIS P1 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Traj33-201ENSMUST00000103708 57 ntAPPRIS P1 BASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm27579-201ENSMUST00000158113 63 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Olfr1041-ps1-201ENSMUST00000215884 271 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 mt-Tr-201ENSMUST00000082412 68 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm23344-201ENSMUST00000083818 68 ntBASIC-1.88□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm17020-201ENSMUST00000172274 274 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Mir7673-201ENSMUST00000184567 64 ntBASIC-1.89□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm22708-201ENSMUST00000158987 103 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm44922-201ENSMUST00000206690 90 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 AC122327.1-201ENSMUST00000220778 108 ntBASIC-1.9□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm22709-201ENSMUST00000116893 111 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Mir122-201ENSMUST00000083468 66 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.71
Ccdc171E9Q1U1 Gm23986-201ENSMUST00000157144 63 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm23351-201ENSMUST00000158427 125 ntBASIC-1.91□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm45125-201ENSMUST00000206908 151 ntBASIC-1.92□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm24718-201ENSMUST00000157521 136 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Snord80-202ENSMUST00000199023 77 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Olfr880-ps1-201ENSMUST00000212344 229 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 mt-Ts2-201ENSMUST00000082416 59 ntBASIC-1.93□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Mir466b-7-201ENSMUST00000103804 88 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Mir466b-5-201ENSMUST00000103900 88 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm14838-201ENSMUST00000118913 248 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm23955-201ENSMUST00000157214 100 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm25493-201ENSMUST00000157375 103 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm22446-201ENSMUST00000180108 104 ntBASIC-1.94□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Mir21b-201ENSMUST00000184317 108 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Mir494-201ENSMUST00000093632 85 ntBASIC-1.95□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm37545-201ENSMUST00000186512 148 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-1.96□□□□□ -2.72
Ccdc171E9Q1U1 Gm25915-201ENSMUST00000104265 126 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
Ccdc171E9Q1U1 Gm23909-201ENSMUST00000104598 131 ntBASIC-1.97□□□□□ -2.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms