Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25522-201ENSMUST00000158394 105 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC157602.1-201ENSMUST00000197446 105 ntBASIC-0,42□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Traj38-201ENSMUST00000103704 62 ntAPPRIS P1 BASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord64-201ENSMUST00000104003 67 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23483-201ENSMUST00000104179 108 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22319-201ENSMUST00000157147 122 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm17528-201ENSMUST00000171026 239 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43324-201ENSMUST00000197482 289 ntBASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Atp8-201ENSMUST00000082407 204 ntAPPRIS P1 BASIC-0,43□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir467g-201ENSMUST00000116906 120 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44470-201ENSMUST00000203913 142 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25081-201ENSMUST00000082534 108 ntBASIC-0,44□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23314-201ENSMUST00000157218 107 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24947-201ENSMUST00000158334 110 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25249-201ENSMUST00000175471 78 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45429-201ENSMUST00000209527 172 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mirlet7a-1-201ENSMUST00000083487 94 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25186-201ENSMUST00000083909 108 ntBASIC-0,45□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26421-201ENSMUST00000104279 132 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24887-201ENSMUST00000104386 108 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22558-201ENSMUST00000157326 95 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm43977-201ENSMUST00000203970 189 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25802-201ENSMUST00000082639 77 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23056-201ENSMUST00000082803 111 ntBASIC-0,46□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir487b-201ENSMUST00000102265 82 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snora26-201ENSMUST00000175614 121 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44322-201ENSMUST00000196830 115 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25401-201ENSMUST00000082975 106 ntBASIC-0,47□□□□□ -2,48
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25275-201ENSMUST00000104297 129 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26337-201ENSMUST00000178000 79 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24508-201ENSMUST00000180104 107 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm38298-201ENSMUST00000193578 118 ntBASIC-0,48□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm11116-201ENSMUST00000113257 54 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24587-201ENSMUST00000116697 89 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm12086-201ENSMUST00000120863 228 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24877-201ENSMUST00000158779 116 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir7116-201ENSMUST00000195956 70 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC129019.2-201ENSMUST00000222063 202 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Tn-201ENSMUST00000082399 71 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir141-201ENSMUST00000083540 72 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24697-201ENSMUST00000083881 107 ntBASIC-0,49□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25889-201ENSMUST00000157775 107 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snora16a-202ENSMUST00000196061 137 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm6607-201ENSMUST00000215035 328 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24455-201ENSMUST00000083348 131 ntBASIC-0,5□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23500-201ENSMUST00000157735 98 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22607-201ENSMUST00000158291 105 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23922-201ENSMUST00000178792 79 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24657-201ENSMUST00000180085 79 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22996-201ENSMUST00000180236 79 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir6237-201ENSMUST00000183808 91 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC165138.1-201ENSMUST00000226984 270 ntBASIC-0,51□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Traj43-201ENSMUST00000103699 57 ntAPPRIS P1 BASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24468-201ENSMUST00000104489 104 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23651-201ENSMUST00000116755 120 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22031-201ENSMUST00000116945 126 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25978-201ENSMUST00000158698 90 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26359-201ENSMUST00000158873 101 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26291-201ENSMUST00000158889 137 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm42677-201ENSMUST00000196363 127 ntBASIC-0,52□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24580-201ENSMUST00000103965 131 ntBASIC-0,53□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23528-201ENSMUST00000104571 132 ntBASIC-0,53□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25425-201ENSMUST00000157611 96 ntBASIC-0,53□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm37796-201ENSMUST00000195327 134 ntBASIC-0,53□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snora16a-201ENSMUST00000083163 136 ntBASIC-0,53□□□□□ -2,49
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25510-201ENSMUST00000116986 123 ntBASIC-0,54□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Igkv13-78-1-201ENSMUST00000199298 200 ntBASIC-0,54□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Tt-201ENSMUST00000082422 67 ntBASIC-0,54□□□□□ -2,5
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm10351-201ENSMUST00000087694 125 ntBASIC-0,55□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC164561.1-201ENSMUST00000220414 115 ntBASIC-0,56□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26412-201ENSMUST00000157666 55 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24823-201ENSMUST00000175092 91 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25472-201ENSMUST00000175454 78 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm44859-201ENSMUST00000207831 94 ntBASIC-0,57□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24894-201ENSMUST00000122744 118 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24064-201ENSMUST00000157486 106 ntBASIC-0,58□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25388-201ENSMUST00000157339 151 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25772-201ENSMUST00000158574 56 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm27749-201ENSMUST00000183651 125 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26207-201ENSMUST00000082909 104 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord42b-201ENSMUST00000083742 69 ntBASIC-0,59□□□□□ -2,5
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25622-201ENSMUST00000157217 104 ntBASIC-0,6□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23988-201ENSMUST00000117034 122 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24868-201ENSMUST00000157265 136 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm24077-201ENSMUST00000158183 136 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25596-201ENSMUST00000178368 107 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm39149-201ENSMUST00000210258 186 ntTSL 5 BASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23690-201ENSMUST00000083036 94 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir7-1-201ENSMUST00000083500 108 ntBASIC-0,61□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 AC140930.2-201ENSMUST00000221803 109 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 mt-Tl1-201ENSMUST00000082391 75 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm25137-201ENSMUST00000083251 110 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Mir96-201ENSMUST00000083652 106 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm26109-201ENSMUST00000083970 70 ntBASIC-0,62□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm23434-201ENSMUST00000157179 100 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm22157-201ENSMUST00000158410 104 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm45741-201ENSMUST00000212661 152 ntTSL 1 (best) BASIC-0,63□□□□□ -2,51
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Snord49b-201ENSMUST00000082503 72 ntBASIC-0,63□□□□□ -2,51
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